Новости онкологии

15 июня 2020

Для диагностики рака впервые применили РНК-секвенирование

Этот метод дешевле и быстрее стандартного иммуногистохимического исследования.

Биологи впервые диагностировали раковую опухоль с помощью секвенирования РНК – метода, который позволяет отслеживать изменения в активности отдельных генов в клетках. Об этом пишет пресс-служба МФТИ со ссылкой на статью в научном журнале Biomedicines.

«Мы впервые показали, что результаты РНК-анализа и иммуногистохимических исследований прекрасно соответствуют друг другу. Только для последних нужно сделать намного больше экспериментов и потратить гораздо больше материала. Секвенирование РНК позволяет сразу количественно охарактеризовать работу всех 20 тысяч генов, кодирующих белки», – рассказал один из авторов исследования, заведующий лабораторией в МФТИ Антон Буздин.

По статистике Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ), различные формы рака сейчас находятся на втором месте среди всех возможных причин смерти. Примерно каждый шестой человек умирает от злокачественных опухолей или связанных с ними осложнений, и только за прошлый год от рака умерли почти 10 млн. человек по всему миру.

Около 90% этих смертей связаны с тем, что врачи или сам больной обнаруживают рак слишком поздно, когда его клетки уже начинают распространяться по организму, а иммунитет не может подавить метастазы. Поэтому ранняя диагностика рака сегодня остается одним из главных приоритетов как для врачей, так и для ученых.

Буздин и его коллеги сделали большой шаг в сторону создания простых и дешевых систем диагностики рака. С помощью их методики можно искать следы самых разных типов опухолей по характерным изменениям в работе всех генов клеток.

Новая диагностика рака

Как правило, медики определяют конкретный тип рака, от которого страдает пациент, с помощью иммуногистохимического исследования. Для этого ученые извлекают небольшой фрагмент опухоли из тела, погружают его в парафин и разрезают на множество тонких слоев. Эти слои окрашиваются при помощи специальных антител, которые могут присоединяться к различным белкам, молекулы которых раковые клетки вырабатывают в больших количествах.

Как правило, у каждого типа рака есть свой собственный набор подобных белковых маркеров, поэтому его диагностика – очень сложная и дорогая процедура. Российские и швейцарские ученые выяснили, как сделать этот процесс быстрее и дешевле, используя те же срезы опухолей, которые применяются при иммуногистохимии.

Буздин и его команда предположили, что те же самые изменения в работе генов, которые фиксируются при помощи антител, можно обнаружить, используя секвенирование РНК. Они проверили, так ли это на самом деле, на 60 образцах опухолей, извлеченных из груди и легких нескольких пациентов, а также из их лимфатических узлов.

Ученые подготовили срезы этих новообразований и обработали их и тем, и другим образом. Далее ученые следили за тем, как менялась активность четырех ключевых генов, связанных с развитием рака груди, а также гена PD-L1, нарушения в работе которого служат главным индикатором появления одной из распространенных форм рака легких.

Эксперименты показали, что результаты работы традиционной методики диагностики рака и РНК-секвенирования полностью совпали. Как считают ученые, это говорит о том, что их подход можно уже сейчас применять в медицинской практике для определения типа опухолей и выработки оптимальных стратегий лечения раковых больных.

Источник: nauka.tass.ru