Онкогеномика. Мастер-класс проф. Д.В. Залетаева

Функциональные маркеры канцерогенеза

Онкогеномика. Функциональные маркеры канцерогенеза

Механизм метилирования ДНК

Мишень метилирования в ДНК – последовательность CpG. В геноме имеются два типа распределения CpG-динуклеотидов: около 80% составляют рассеянные CpG в виде одиночных динуклеотидов и районы обогащения CpG, называемые CpG-островками.

Одиночные CpG обнаруживаются чаще всего в межгенных и реже – в транскрибируемых последовательностях. CpG-островки располагаются вблизи структурных генов, преимущественно в 5'-районах, которые содержат регуляторные последовательности, характерные для промоторов. CpG-островки присутствуют в промоторных районах 60% генов. За редким исключением (импринтированные гены) CpG-островки промоторных районов в нормальных тканях не метилированы, что свидетельствует о функционально нормальном состоянии гена.

Как правило, тканеспецифические гены не имеют в своих промоторах CpG островков. В них присутствуют одиночные CpG-динуклеотиды, степень метилирования которых варьирует в широких пределах и препятствует локальному связыванию факторов транскрипции.

Только одно основание ДНК может быть модифицировано посредством энзиматического метилирования – цитозин. Метилирование является обратимой ковалентной модификацией ДНК, когда цитозиновый остаток в CрG-динуклеотиде метилируется в позиции N5 пиримидинового кольца с помощью ферментов ДНК-метилтрансфераз. Остатки 5-метилцитозина могут удаляться из ДНК благодаря активности гликозилазы или ДНК-деметилазы. Фермент способен узнавать метилированные CpG-динуклеотиды, трансформировать 5-метилцитозин в цитозин, не нарушая целостности ДНК, и осуществлять деметилирование на значительном участке нуклеотидной последовательности (Li E., Bird A., 2007).

Современные методы анализа метилирования ДНК в геноме можно условно разделить на две группы. Первая в связи с простой, эффективностью и экономичностью используется в практической ДНК-диагностике – методы анализа метилирования известных генов. Вторая группа методов, более трудоемких, капризных, неэкономичных, – анализ профиля метилирования всего генома для поиска аномалий метилирования генов в определенном типе опухолей или на разных стадиях онкологического процесса и для поиска новых генов, вовлеченных в канцерогенез.

 
Служба «Ясное утро». Всероссийская горячая линия психологической помощи онкологическим больным и их близким
Content

Уважаемые коллеги

При обнаружении ошибки просим информировать нас об этом.

Имя

E-mail *

Местонахождение ошибки *

Подробнее: в каком абзаце ошибка, в чем она состоит *

Картинка с кодом

Обновить картинку Прослушать код Введите код:

Согласен Данный веб-сайт содержит информацию для специалистов в области медицины. В соответствии с действующим законодательством доступ к такой информации может быть предоставлен только медицинским и фармацевтическим работникам. Нажимая «Согласен», вы подтверждаете, что являетесь медицинским или фармацевтическим работником и берете на себя ответственность за последствия, вызванные возможным нарушением указанного ограничения. Информация на данном сайте не должна использоваться пациентами для самостоятельной диагностики и лечения и не может быть заменой очной консультации врача.

Сайт использует файлы cookies для более комфортной работы пользователя. Продолжая просмотр страниц сайта, вы соглашаетесь с использованием файлов cookies, а также с обработкой ваших персональных данных в соответствии с Политикой конфиденциальности.